En este sector de la Región de Los Lagos se caracteriza por tener una gran cantidad de recursos hídricos debido a los glaciares, la lluvia y el relieve. Entre los ríos más importantes están:
Río Petrohué: nace en el lago Todos los Santos y drena una hoya de 3.036 km2.
También podemos encontrar en la Región de Los Lagos al Río Maullín, Río Puelo, Río Yelcho, Lago Llanquihue, Llago Rupanco, Lago Todos los Santos.